Высшее образование религиозной (мусульманской) направленности можно получить в исламских университетах и высших медресе. В университетах можно получить как духовное, так и светское образование. К светским специальностям относятся «Теология», «Лингвистика», «Культурология», «Регионоведение», «Искусство и гуманитарные науки», к религиозным – «Коранические науки» и «Шариатские науки». Выпускникам мусульманских вузов выдается диплом бакалавра по соответствующей специальности. Кроме этого они получают диплом о высшем религиозном образовании и дополнительную специальность «Имам-хатыб, преподаватель основ ислама» (только мужчины).

Учебные дисциплины обычно можно разделить на три блока:

• религиозной направленности
• общегуманитарные
• языковедческие.

К религиозным дисциплинам относятся акида (исламское вероучение), таджвид и тафсир (чтение и толкование Корана), ахляк (исламская этика), фикх (мусульманское законоведение), история Ислама, воспитание в Исламе, призыв к Исламу (правила и методы приобщения народа к Исламу).

Поступающие в данные вузы не обязательно должны быть мусульманского вероисповедания. Возрастные ограничения тоже существуют не везде. Абитуриент должен иметь полное среднее, среднее специальное образование или высшее образование. Основанием для поступления являются результаты ЕГЭ или вступительные испытания. Поступающим на религиозные специальности наряду с другими документами понадобится еще и рекомендация имама, заверенная печатью мусульманского религиозного объединения.

В высшие медресе принимаются выпускники 9 и 11 классов. Они зачисляются по результатам вступительных испытаний. Это может быть сочинение (изложение) по русскому или татарскому языку, история России и основы Ислама. Подготовиться к сдаче вступительных экзаменов можно на специальных курсах, которые обычно организуются при медресе. Хорошо подготовленным абитуриентам могут предоставить возможность поступить сразу на 2 или 3 курс.

Юноши и девушки в медресе обучаются раздельно (иногда только на первых 2-3 курсах). В некоторые медресе девушки могут поступить только на заочное отделение.

Чаще всего здесь обучают по специальностям «Исламский шариат и арабский язык» и «Исламские науки и воспитание». Все выпускники могут работать преподавателями шариатских дисциплин, преподавателями основ Ислама, преподавателями арабского языка или переводчиками с арабского языка. Выпускники-мужчины могут стать еще и имам-хатыбами и муэдзинами. Кроме диплома о высшем религиозном образовании выпускники медресе часто получают диплом о среднем специальном образовании по какой-либо светской специальности (например, «Пчеловодство»).