если переводишься на платное отделение, то не думаю, что это как-то повлияет. Если на бюджет берут по переводу, тогда это уже важнее, тем более, если это ключевые предметы в дисциплине. А по сути, тройка - это ведь "удовлетворительно" :) Значит удовлетворяешь требованиям.