На рубеже тысячелетий химия вновь востребована обществом, промышленностью и сельским хозяйством. В настоящее время на химическом факультете функционируют четыре кафедры, которые проводят обучение студентов по шести специализациям в рамках основной квалификации «Химик». Обучение ведут высококвалифицированные преподаватели и сотрудники, признанные не только на федеральном, но и международном уровне.

Научное направление кафедры неорганической химии – химия комплексных соединений, химия твердого тела, кристаллохимия. Работа студентов и сотрудников кафедры поддерживается грантами Российского Фонда Фундаментальных Исследований и отмечена главной премией МАИК «Наука». Выпускники кафедры владеют современными методами исследования: рентгенофазовым и рентгеноструктурным анализом, ИК-спектроскопией, термографией и термогравиметрией.

Кафедра органической, биоорганической и медицинской химии (специализация органическая химия) специализируется в области органического синтеза, облик которого за последние годы значительно изменился. На кафедре проводятся исследования, связанные с поиском методов синтеза соединений, обладающих антибактериальными и антивирусными свойствами, разрабатываются обучающие компьютерные программы по различным разделам органической химии и химии природных соединений.

Первая и единственная в стране кафедра физической химии и хроматографии (специализации физическая химия, медицинская химия, нефтехимия) готовит специалистов в области хроматографии. На кафедре читают уникальные спецкурсы по газовой, жидкостной, сверхкритической, флюидной хроматографии.

Кафедра аналитической и экспертной химии (специализации аналитическая химия, химия окружающей среды, химическая экспертиза и экологическая безопасность) – единственная в России, готовит специалистов для химических лабораторий; экспертов-криминалистов для экспертно-криминалистических центров и управлений УВД, лабораторий Комитета госнаркоконтроля, судебной экспертизы, судмедэкспертизы; химиков-аналитиков для лабораторий Комитета по защите прав потребителей.

Многие аспиранты и выпускники факультета являются ведущими специалистами в Швеции, Германии, Франции.