Филиал - самостоятельное учебное заведение, как я правильно понял, филиалы отдельно от головного вуза проходят лицензирование, что позволяет им вести образовательную деятельность. Поэтому филиал выдает свой диплом, а не головного, в вашем случае не ИрГУПС.

А мне кажется филиал выдает диплом головного вуза. Вот к нам в школу приходили представители нескольких приемных комиссий, в основном представляли местные филиалы крупных российских вузов. И все в один голос утверждали одно из главных преимуществ обучения в филиале: ДИПЛОМ МОСКОВСКОГО ВУЗА, а не нашего маленького городка. Вот так!