Вам возможно нужно подавать апелляцию, а делать это нужно в течение 2 дней после объявления результатов. Хотя пересдачу разрешают даже без апелляции, если участник не завершил ЕГЭ по причине болезни. А вы, так понимаю, завершили его.. Ну в общем стоит попробовать подать апелляцию о несогласии с результатами. Плюс, возможно, понадобится мед.справка.

В вашем случае, если всё было серьёзно и справка у вас была соответствующая, можно было бы ЕГЭ пропустить, а потом сдать в доп. день. Но раз уж вы пошли на ЕГЭ и сдали его до конца, вряд ли апелляцию рассмотрят и удовлетворят, потому что значит, не так уж всё было плохо...