Да, разумеется у вас будет шанс получить там работу, в каком бы вузе они не учились. Нет каких-то условий по окончанию именно этих двух вузов, чтобы работать в МИДе. Просто это два отличных вуза и определенно при приеме на работу их выпускники очень ценятся:) НО главное, что ценится, это ваши знания и желание работать!