Думаю не стоит волноваться. Ведь в новом паспорте на последней странице должны быть записи о предыдущих паспортах, с номером и серией документа. Так что скорее всего этого будет достаточно.

Я когда писала ЕГЭ у нас сверяли номер паспорта и номер на уведомлении. Случаев, чтобы не сходилось я не знаю, так что сказать что будет я не могу, но могут не допустить, лучше сходите у себя и спросите на всякий случай, мало ли что.